ABSTRACT
Background: The treatment of Clostridioides difficile is based on an antibiotics cycle, but for individuals who have more than two recurrences, fecal microbiota transplantation can be considered as a therapeutic option. Objective: To describe the technique and results of fecal microbiota transplantation performed for recurrent infection by Clostridioides difficile. Methods: Retrospective, cross-sectional study based on a review of medical records of patients undergoing transplantation of fecal microbiota. Data were obtained on the criteria used to select the donor, the preparation of stools in the laboratory and the method of delivery of the material offered, as well as information regarding the characteristics of the recipient, such as: gender, age, comorbidities, hospitalizations, use of antibiotics prior to infection, clinical presentation, diagnosis and treatments performed for Clostridioides difficile. After transplantation, data on efficacy, outcome, follow-up time and procedure complications were considered. Results: Between 2012 and 2019, 11 patients underwent fecal microbiota transplantation. The use of antibiotics prior to infection occurred in 9 patients, no patient was hospitalized in the previous 6 months due to another etiology. All had at least 2 cycles of vancomycin for recurrent disease. Of the total of 11 patients, 2 required 2 infusions and 1 patient required 3, totaling 15 fecal microbiota transplants. The success rate was 81.8% with only one infusion and 90.9% resolution considering patients who needed more than one infusion. Conclusion: Fecal microbiota transplantation is a feasible therapy with resolution in 90.9% of cases as a treatment for recurrent Clostridioides difficile infection.
Contexto: O tratamento do Clostridioides difficile é baseado em ciclo antimicrobiano, mas para os indivíduos que apresentam mais de duas recorrências, pode-se considerar o transplante de microbiota fecal como opção terapêutica. Objetivo: Descrever a técnica e os resultados do transplante de microbiota fecal realizados para infecção recorrente por Clostridioides difficile. Métodos: Estudo retrospectivo, transversal, baseado em revisão de prontuários de pacientes submetidos ao transplante de microbiota fecal. Foram obtidos dados sobre os critérios empregados para seleção do doador, o preparo das fezes e o método de entrega do material, além de informações referentes às características do receptor, como: sexo, idade, comorbidades, internamentos, uso de antimicrobiano prévio à infecção, apresentação clínica, diagnóstico e tratamentos realizados para o Clostridioides difficile. Após o transplante, dados sobre eficácia, desfecho, tempo de seguimento e complicações do procedimento foram considerados. Resultados: Entre 2012 e 2019, 11 pacientes foram submetidos ao transplante de microbiota fecal. O uso de antimicrobiano prévio à infecção ocorreu em 9 pacientes, nenhum paciente internou nos 6 meses anteriores por outra etiologia. Todos fizeram pelo menos 2 ciclos de vancomicina para doença recorrente. Do total de 11 pacientes, 2 necessitaram de 2 infusões e 1 paciente necessitou de 3, totalizando 15 transplantes de microbiota fecal. O sucesso foi de 81,8% com apenas uma infusão e resolução de 90,9% considerando pacientes que necessitaram de mais de uma infusão. Conclusão: O transplante de microbiota fecal é uma terapia factível e com resolução em 90,9% dos casos como tratamento de infecção recorrente por Clostridioides difficile.
Subject(s)
Humans , Clostridioides difficile , Clostridium Infections , Diarrhea/therapy , Fecal Microbiota Transplantation , Dysbiosis , Observational Study , Anti-Bacterial Agents/therapeutic useABSTRACT
ABSTRACT BACKGROUND: Fecal microbiota transplantation (FMT) is an important therapeutic option for recurrent or refractory Clostridioides difficile infection, being a safe and effective method. Initial results suggest that FMT also plays an important role in other conditions whose pathogenesis involves alteration of the intestinal microbiota. However, its systematized use is not widespread, especially in Brazil. In the last decade, multiple reports and several cases emerged using different protocols for FMT, without standardization of methods and with variable response rates. In Brazil, few isolated cases of FMT have been reported without the implantation of a Fecal Microbiota Transplantation Center (FMTC). OBJECTIVE: The main objective of this study is to describe the process of implanting a FMTC with a stool bank, in a Brazilian university hospital for treatment of recurrent and refractory C. difficile infection. METHODS: The center was structured within the criteria required by international organizations such as the Food and Drug Administration, the European Fecal Microbiota Transplant Group and in line with national epidemiological and regulatory aspects. RESULTS: A whole platform involved in structuring a transplant center with stool bank was established. The criteria for donor selection, processing and storage of samples, handling of recipients before and after the procedure, routes of administration, short and long-term follow-up of transplant patients were determined. Donor selection was conducted in three stages: pre-screening, clinical evaluation and laboratory screening. Most of the candidates were excluded in the first (75.4%) and second stage (72.7%). The main clinical exclusion criteria were: recent acute diarrhea, overweight (body mass index ≥25 kg/m2) and chronic gastrointestinal disorders. Four of the 134 candidates were selected after full screening, with a donor detection rate of 3%. CONCLUSION: The implantation of a transplant center, unprecedented in our country, allows the access of patients with recurrent or refractory C. difficile infection to innovative, safe treatment, with a high success rate and little available in Brazil. Proper selection of qualified donors is vital in the process of implementing a FMTC. The rigorous clinical evaluation of donors allowed the rational use of resources. A transplant center enables treatment on demand, on a larger scale, less personalized, with more security and traceability. This protocol provides subsidies for conducting FMT in emerging countries.
RESUMO CONTEXTO: O Transplante de microbiota fecal (TMF) é uma importante opção terapêutica para a infecção recorrente ou refratária pelo Clostridioides difficile, sendo método seguro e eficaz. Resultados iniciais sugerem que o TMF também desempenha papel relevante em outras afecções cuja patogênese envolve a alteração da microbiota intestinal. No entanto, seu uso sistematizado é pouco difundido, especialmente no Brasil. Na última década, surgiram múltiplos relatos e séries de casos utilizando diferentes protocolos para o TMF, sem padronização de métodos e com taxas de resposta variáveis. No Brasil, poucos casos isolados de TMF foram relatados sem a implantação de um Centro de Transplante de Microbiota Fecal (CTMF). OBJETIVO: O principal objetivo deste estudo foi descrever o processo de implantação de um CTMF com banco de fezes, em hospital universitário brasileiro, para tratamento de infecção recorrente e refratária pelo C. difficile. MÉTODOS: O CTMF foi estruturado dentro dos critérios exigidos e aprovados por organismos internacionais como o Food and Drug Administration, Grupo Europeu de Transplante de Microbiota Fecal e em consonância com os aspectos epidemiológicos e regulatórios nacionais. RESULTADOS: Foi estabelecida toda uma plataforma envolvida na estruturação de um centro de transplante com fezes congeladas. Determinou-se os critérios para seleção de doadores, processamento e armazenamento de amostras, manejo dos receptores antes e após o procedimento, uniformização de vias de administração do substrato fecal e seguimento a curto e longo prazo dos pacientes transplantados. A seleção dos doadores foi conduzida em três etapas: pré-triagem, avaliação clínica e exames laboratoriais. Boa parte dos candidatos foram excluídos na primeira (75,4%) e segunda etapa (72,7%). Os principais critérios clínicos de exclusão foram: diarreia aguda recente, excesso de peso (IMC ≥25 kg/m2) e distúrbios gastrointestinais crônicos. Quatro dos 134 candidatos foram selecionados após a triagem completa, com taxa de detecção de doadores de 3%. CONCLUSÃO: A implantação de um CTMF, inédito no nosso meio, possibilita o acesso de pacientes com infecção recorrente e refratária pelo C. difficile a tratamento inovador, seguro, com elevada taxa de sucesso e pouco disponível no Brasil. A seleção apropriada de doadores qualificados é vital no processo de implantação de um CTMF. A avaliação clínica rigorosa dos doadores permitiu o uso racional de recursos para realização de exames laboratoriais. Um CTMF possibilita tratamento sob demanda, em maior escala, menos personalizados, com mais segurança e rastreabilidade. Este protocolo fornece subsídios para a realização de TMF em países emergentes.
Subject(s)
Humans , Fecal Microbiota Transplantation , Brazil , Clostridioides difficile , Treatment Outcome , Clostridium Infections/therapy , FecesABSTRACT
ABSTRACT Introduction: The identification of anaerobic bacteria by conventional methods employed in clinical laboratories requires a lot of work and a long response time [turnaround time (TAT)]. Matrix assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is an accurate, rapid and inexpensive technique with promising results for bacterial identification. Objective: To evaluate the MALDI-TOF mass spectrometry (VITEK-MS, bioMérieux, France) compared to the ANC card (VITEK 2, bioMérieux, France) for the identification of anaerobes, and also veriying the cost variation between both methodologies. Methods: 421 anaerobes were concomitantly identified by ANC (VITEK 2) and MALDI-TOF (VITEK MS). The conflicting results or those presenting low differentiation of the species were subjected to the 16S ribosomal ribonucleic acid (rRNA) sequencing. Results: Thirty-five strains were not identified by ANC (VITEK 2), and only one isolate was not identified by MALDI-TOF (VITEK MS). From the 386 anaerobes identified by the two methodologies, 97% agreement was observed on the identification of genus and species between the methodologies. Thirteen (3%) isolates were submitted to 16S sequencing. The agreement observed was 70% using ANC (VITEK 2) using 92% by MALDI-TOF (VITEK MS). Conclusion: Both methodologies showed an excellent performance for the identification of the strains tested with great differences in relation to cost-benefit. MALDI-TOF MS allowed 35 additional identifications and a saving of BRL$ 7,786 with the release of culture positive result five days ahead of the ANC (VITEK 2). TAT reduction may contribute to a successful clinical resolution.
RESUMO Introdução: A identificação das bactérias anaeróbias por métodos convencionais empregados nos laboratórios clínicos demanda muito trabalho e um longo tempo de resposta (TAT). A espectrometria de massa por ionização e dessorção a laser assistida por matriz (MALDI-TOF MS) é uma técnica precisa, rápida e barata, com resultados promissores para a identificação bacteriana. Objetivo: Avaliar a espectrometria de massas MALDI-TOF (VITEK MS, bioMérieux, France) diante do cartão ANC (VITEK 2, bioMérieux, France) para a identificação de anaeróbios, bem como verificar a variação de custos entre as metodologias. Métodos: Foram identificados 421 anaeróbios concomitantemente pelo ANC (VITEK 2) e pelo MALDI-TOF (VITEK MS). Os resultados discordantes ou que apresentaram baixa discriminação das espécies foram submetidos ao sequenciamento do 16S do ácido ribonucleico ribossonal (rRNA). Resultados: Trinta e cinco cepas não foram identificadas pelo ANC (VITEK 2), e somente um isolado ficou sem identificação pelo MALDI-TOF (VITEK MS). Dos 386 anaeróbios identificados pelas duas metodologias, a concordância na identificação de gênero e espécie foi observada em 97%. Treze (3%) isolados foram submetidos ao sequenciamento do 16S; a concordância observada foi de 70% com o ANC (VITEK 2) e 92% com MALDI-TOF (VITEK MS). Conclusão: Ambas as metodologias demonstraram ótimo desempenho para identificação das cepas testadas com grandes diferenças em relação ao custo-benefício. O MALDI-TOF MS permitiu 35 identificações adicionais e uma economia de R$ 7.786,00 com a liberação do resultado positivo da cultura cinco dias à frente do ANC (VITEK 2). A redução do TAT pode contribuir para uma resolução clínica bem-sucedida.